Cục Trồng trọt (Bộ NNPTNT) cho biết, do khả năng tự sản xuất giống lúa lai F1 tại VN chỉ đạt khoảng 3.500-4.000 tấn/năm, tương đương 24% nhu cầu, nên mỗi năm VN phải nhập khoảng 13.000 tấn hạt giống lúa lai. Đáng lưu ý trong năm 2008, diện tích sản xuất hạt lai tiếp tục giảm và hiện chỉ còn khoảng 1.200ha, xấp xỉ 50% so với nhiều năm trước. Trong số này có đến 46/219 mẫu giống không đạt chuẩn. Khó khăn lớn nhất trong hoạt động sản xuất lúa lai hiện nay là do VN không chủ động được nguồn giống bố mẹ, phải phụ thuộc vào hạt giống bố mẹ nhập từ Trung Quốc.

Trong khi đó, giá thành sản xuất giống lúa lai trong nước lên tới 25.000đ/kg, cao hơn giá nhập ngoại và các DN không mặn mà với việc sản xuất lúa lai do tính rủi ro cao.